Date de début
Objectifs visés
La dynamique d’une macromolécule biologique joue un rôle prépondérant pour l’accomplissement de sa fonction.
L’objectif de la formation est d’initier les participant.e.s à différentes méthodes in silico permettant de fournir des informations dynamiques et conformationnelles.
Contenu
Organisation de la formation
Partie théorique (8h)
Les échelles de temps, les échelles de mouvement
Dynamique moléculaire
Modèles élastiques
Analyse de trajectoires et exploration de données structurales au cours du temps
Partie pratique (27h)
Dynamique d’une protéine globulaire
Dynamique d’une protéine transmembranaire
Changement conformationnel de grande amplitude par dynamique vibrationnelle.
Du 22 au 26 juin 2020
5 jours / 35 heures
2450 €
(TVA 0% incluse)
Contrôle des connaissances
MOYENS PERMETTANT DE SUIVRE L’EXECUTION DE L’ACTION ET D’EN APPRECIER LES RESULTATS:
Liste d’émargement
Questionnaire de satisfaction
MODALITES D’EVALUATION:
Attestation de formation délivrée par l’Université
Aménagements particuliers
MOYENS PEDAGOGIQUES ET TECHNIQUES D’ENCADREMENT:
Ressources humaines :
Enseignant.e.s-chercheur.e.s de l’Université Paris Diderot
Ressources matérielles :
Supports pédagogiques format PDF sur clé USB
Public Cible
Prérequis
Technicien.ne.s, ingénieur.e.s et chercheur.e.s des entreprises et des collectivités dans le domaine des sciences du vivant.
Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 8 maximum.
Pré-requis
Connaissance de base en structures 3D des protéines. La connaissance de l’environnement Unix/Linux est recommandée.
Droits de scolarité
2450 €
Compétences visées
Les aspects théoriques seront abordés afin de clairement préciser les limites et les possibilités de telles approches. Différents exemples seront étudiés qui caractériseront différentes échelles de mouvement en présence de différents types d’environnement. Ainsi, le cas des protéines solubles et celui des protéines membranaires seront traités spécifiquement.
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